| ვერსია | 4.5 |
|---|---|
| გამომცემელი | Bioinformatics Solutions |
| Გამოშვების თარიღი | 10 მაი. 2010 |
| Თარიღი დამატებულია | 16 ივლ. 2010 |
| მოთხოვნები | Windows XP/Vista/7 |
| მოთხოვნები | None |
| სულ ჩამოტვირთვების | 9 464 |
| ჩამოტვირთვები კვირაში | 9 |
| ფასი | Free |
აღწერა
RAPTOR არის ინოვაციური პროგრამა, რომელიც შექმნილია ცილის სტრუქტურის ზუსტი პროგნოზირებისთვის. იგი აერთიანებს მოწინავე ანალიზის საშუალებებს ერთ ინტეგრირებულ პროგრამულ გადაწყვეტაში და უზრუნველყოფს სამ განსხვავებულ ძაფის მეთოდს. RAPTOR– ის მთელი მთელი პროგრამირების ოპტიმიზაციის უნიკალური მიდგომა ყველაზე ეფექტურია დაბალი თანმიმდევრობის ჰომოლოგიური სამიზნეების სტრუქტურული შაბლონების მოსაძებნად და შეუძლია შექმნას მაღალი ხარისხის მოდელები. მარტივად გამოსაყენებელი ინტერფეისი და ადვილად გასაგები E მნიშვნელობები იდეალურია დამწყებთათვის და ექსპერტებისთვის. უპირველეს ყოვლისა, გამოცემის ინტუიციური ჩვენება მომხმარებლებს საშუალებას აძლევს, უბრალოდ ერთი შეხედვით გაიგონ შედეგები. სამიზნე ცილის თანმიმდევრობის გათვალისწინებით, თუ არსებობს ჰომოლოგიური ცილა, ცნობილი 3D სტრუქტურით, მისი პოვნა შესაძლებელია თანმიმდევრობის ძიების საშუალებების გამოყენებით, როგორიცაა PSI-BLAST, ასევე მოცემულია RAPTOR- ში. შემდეგ სამიზნის სტრუქტურა აგებულია ცნობილი სტრუქტურიდან; ამასთან, როდესაც თანმიმდევრობის ჰომოლოგია არ არის მნიშვნელოვანი, ანუ 25% -ზე ნაკლები, PSI-BLAST ვერ გამოდგება დარწმუნებული ჰიტით. PSI-BLAST- ისგან განსხვავებით, რომელიც უბრალოდ ახდენს თანმიმდევრობის ძიებას, ცილების ძაფს, ნაკეცების ამოცნობას, იყენებს როგორც ჰომოლოგიურ, ისე სტრუქტურულ ინფორმაციას. ის სკანირებს ცილის მიმდევრობას უცნობი სტრუქტურით, ცნობილი სტრუქტურების მონაცემთა ბაზაზე. შეფასების ფუნქციის გამოყენებით და სამგანზომილებიან სტრუქტურებსა და წრფივ ცილოვან მიმდევრობებს შორის თავსებადობის ანალიზის ჩატარებით განისაზღვრება საუკეთესო სტრუქტურული შაბლონი, საიდანაც უნდა აშენდეს მიმდევრობის სტრუქტურა. შედეგად, ცილის ძაფი უკეთეს პროგნოზს იძლევა ვიდრე ჰომოლოგიური მოდელირება, როდესაც არსებობს ზღვრული თანმიმდევრობის ჰომოლოგია.
